No contexto operacional, o MacroZEE-MA está seguindo as orientações e procedimentos definidos pelas diretrizes metodológicas do Projeto ZEE Brasil e está sendo executado em quatro fases de trabalho, que abrangem o Planejamento do Projeto, o Diagnóstico, o Prognóstico e os Subsídios à Implementação. Cada uma dessas fases tem conexão de atividades, tarefas e produtos bem definidos, a fim de proporcionar uma rotina de aperfeiçoamento e realimentação.

Fonte: BRASIL. Ministério do Meio Ambiente. Programa Zoneamento Ecológico-Econômico: diretrizes metodológicas para o Zoneamento Ecológico-Econômico do Brasil. Brasília, DF, 2006.